苗木城(なえぎじょう)は中津川市苗木の木曽川を見渡せる場所にあった苗木遠山氏の城。
苗木城は地理的に木曽川を見渡せる場所に築かれている。木曽川は木曾地域から伊勢湾周辺へ木材を運び出すための重要な水路であり、江戸時代の尾張国の経済活動を支えるためにはこの木材が必要であった。苗木藩は不必要に材木を流通し不穏な動きがないかを幕府へ申告する役を負っていた。